생명을 구하는 그래프: 연구 논문과 임상 시험을 연결하여 인류를 구원하는 Neo4j GraphRAG 활용기

편집자 주: 이 프레젠테이션은 다음에서 제공되었습니다.실파 카케라 at 연결: 그래프를 통한 혁신 가속화.

Usha Renal Care Foundation에서는 의료 데이터에 대한 풍부한 지식 저장소를 갖기 위해 자체 구성 맵에 넣을 정보를 수집하고 있다고 해요. 이 계획은 단계적으로 진행될 예정이고, 현재는 초기 단계에 있죠.

핵심 문제: 조각난 데이터

우리가 주목하는 핵심적인 문제는 의료 산업 데이터가 파편화되어 있다는 점이에요. 정보가 이렇게 흩어져 있으면 새로운 임상시험 기회를 찾기가 정말 어렵고, 환자분들이 고통을 겪게 되죠. 이 이니셔티브는 바로 이 점을 연결해서 긍정적인 영향을 주고, 환자분들에게 최고의 의료 서비스를 제공하는 데 목적이 있어요.

NephroBlocks 소개

저희는 데이터를 NephroBlocks와 연결했어요. 'Nephro'는 *신장학(Nephrology)*에서, 'Blocks'는 *블록체인(Blockchain)* 데이터에서 따왔어요. 신장학 데이터에 대한 Knowledge Graph를 만들고, 환자와 의료 기관에서 활용할 수 있도록 하는 거죠. 의료 전문가분들과 이야기를 나눠보면, 가장 큰 어려움 중 하나가 기술이 한 곳에서 다른 곳으로 이전되는 과정이라고 해요. 첨단 기술이 특정 위치에 있더라도, 규정 준수나 인식 문제 때문에 다른 곳에 적용되기까지 시간이 오래 걸릴 수 있다는 거죠. 그래서 NephroBlocks는 모든 사람이 동일한 플랫폼에서 현재 진행 중인 임상 시험과 성공률을 확인할 수 있도록 돕고 있어요.

안타깝게도 임상 시험은 매우 구체적인 모집 기준과 환자 프로필을 요구하기 때문에, 환자분들은 어떤 시험에 참여할 수 있는지 알기 어려워요. 게다가 일부 환자분들은 적절한 신장 전문의 네트워크에 속해 있지 않아서, 임상 시험에 대한 정보를 아예 접하지 못하는 경우도 있죠. 저희는 바로 이 정보 공유 문제를 해결하려고 노력하고 있어요.

NephroBlocks를 만든 이유

Neo4j의 그래프 플랫폼은 데이터 간의 연관성을 찾는 데 정말 유용해요. 덕분에 적절한 임상 시험에 맞는 환자 프로필을 제때 매칭할 수 있게 되었죠. 임상 연구자분들도 서로 협력해서 임상시험 프로필에 맞는 사례를 찾을 수 있고요. 이건 모두에게 좋은 일(win-win)이라고 생각해요.

우선 우샤신장관리재단을 설립하게 된 계기부터 말씀드리고 싶어요. 이 일을 하는 이유는 개인적인 경험과 깊이 관련되어 있어요. 이 이니셔티브는 어머니의 정신과 11년간의 신부전 투병에 대한 헌사로, 어머니의 이름을 따서 만들어졌어요. 어머니는 예상보다 훨씬 오래 생존하셨는데, 그건 기술 덕분이었죠. 저는 그 점이 정말 자랑스럽고, 기술자로서 이 계획을 위해 매일 노력하는 원동력이 되었어요. 어머니는 기술의 도움을 받아 저에게 당연한 어린 시절을 선물해주신 환자였어요.

저는 세상 모든 사람들이 그런 기회를 누릴 자격이 있다고 믿어요. 그래서 생명을 구할 수 있는 기술이 무엇인지 적극적으로 알리고 있는 거죠. Google에서 원하는 정보를 검색할 수 있지만, 모든 정보를 활용할 수 있는 건 아니잖아요. 어머니께서 투병하시던 마지막 단계에는 대부분의 의사들이 해결책이 없다고 말하는 신경병증 문제가 있었어요.

하지만 기술자인 저는 그걸 받아들일 수 없었어요. 분명 다른 방법이 있을 거라고 생각했죠. 어딘가에서 연구나 임상 시험이 진행 중일 수도 있잖아요. 해결책을 찾을 수 없다는 절망감이 NephroBlocks를 만들게 된 계기가 되었어요. 저희는 신장 치료부터 시작했지만, 이 계획은 확장 가능하고 다른 분야에서도 더 큰 성공을 거둘 수 있을 거라고 믿어요.

더 나은 환자 발견을 위한 임상시험과 연구의 연결

제 개인적인 여정과 동기를 말씀드렸으니, 이제 Graph Database를 어떻게 구현했고 앞으로 어떻게 발전시켜나갈지 공유할게요.

온라인에서 연구 논문을 읽고 신경병증에 대한 임상 시험을 검색하는 건 정말 수작업에 가까워요. 모든 사람이 삶의 중요한 순간마다 그렇게 할 수는 없죠. 그래서 이 플랫폼을 구축하면 사람들이 데이터를 더 쉽게 찾고, 연구 논문에서 임상 시험, 환자 프로필까지 한 번에 연결할 수 있게 되는 거예요.

현재 저희는 데이터베이스에 신장 치료와 관련된 5만 건 이상의 임상 시험 데이터를 가지고 있어요. 스크립트를 사용해서 지속적으로 데이터베이스를 업데이트하고, 다양한 신장 관련 연구를 후원하는 기관들과 협력하고 있기도 하고요.

연구에서 공통적인 사건이 발견되면 데이터베이스의 관계 강도가 높아져요. 데이터가 풍부해지면 Semantic Search 단계가 시작되는 거죠.

그래프 Discovery Engine

이제 기술과 Discovery Engine이 어떻게 작동하는지 좀 더 자세히 살펴볼까요? Discovery Engine은 더 나은 Query를 도출하는 데 도움을 줘요. 예를 들어, 10~25세 범위의 당뇨병 환자이면서 만성 신장 질환을 앓고 있는 환자 프로필을 가져올 수 있죠. 그리고 당시 이용 가능한 임상 시험을 기반으로 이들을 재편성하는 거예요. 지금은 신장 전문의분들이 이 데이터를 먼저 사용하는 데 집중하고 있지만, 시스템이 더 발전하면 환자분들에게도 큰 희망을 줄 수 있을 거라고 생각해요. 환자분들이 생존할 기회가 있다는 희망을 가질 수 있다고 상상해보세요!

데이터베이스에서 가장 먼저 보여드리고 싶은 건 임상시험 사례에 대한 데이터예요.

임상 시험의 용량을 보여주는 곳에서 이런 질문들을 할 수 있겠죠. "임상 시험이 활성화되어 있나요?", "지금 모집 중인가요?", "요구 사항은 무엇인가요?", "연령대는 어떻게 되나요?", "어떤 단계에 있나요?" 같은 질문들이요.

다음은 우리가 채운 사례들이에요.

그리고 스폰서 정보도 있네요.

조직과 위치를 기반으로 협회, 후원자, 그리고 그들이 사용하는 자금 유형을 식별할 수 있어요. 이는 환자뿐만 아니라 연구자가 자신의 연구에 어떤 기관이 도움을 줄 수 있는지 식별하는 데도 도움이 되죠.

저장소에 조건을 저장하기도 해요. 예를 들어 만성 신장 질환을 동반한 제2형 당뇨병 같은 조건이죠. 이와 동일한 세부 사항을 가진 것들이 많이 있어요. 따라서 관계의 첫 번째 유형은 후원자와 우리가 채택한 조건의 유형이 되는 거죠.

환자 입장에서 이런 옵션들이 있다는 건 정말 흥미로운 일이죠! 조건과 스폰서 정보가 파란색으로 표시된 임상 시험을 보면, 현재 진행 중인 계획이라는 걸 한눈에 알 수 있어요.

블록체인: 우리 여정의 다음 단계

Neo4j 저장소의 다음 단계는 기부, 기부자, 그리고 기부자들의 분산 네트워크를 가능하게 하는 블록체인을 도입하는 거예요. 입원 환자뿐만 아니라, 이런 종류의 연구에 접근하고 싶어 하는 모든 사람들을 위해 투명한 모듈 형태로 제공하고 싶어요.

결론

저는 여러분이 강력하게 믿는 일을 받아들이시길 권장해요. NephroBlocks를 통해 우리는 모든 정보를 분산 원장에 저장해서, Graph Database와 통합 저장소에 대해 가능한 한 많은 사람들에게 알리기 위해 최선을 다하고 있답니다.

두 가지 미래 지향적인 기술 개념인 Graph Database와 블록체인을 결합하면 헬스케어 산업에서 정말 훌륭한 생태계를 만들 수 있어요. 우리는 세상을 더욱 안전하게 만들기 위해 노력하고 있고, 이 커뮤니티에 함께 가치를 구축하고 더할 수 있기를 기대해요. 저희가 하는 일을 확인해 보시고, 궁금한 점이 있다면 언제든지 문의해주세요! 혁신을 만들어 나가요!

7월 Connections에 등록하고 전문가들이 그래프를 사용하여 실제 문제를 해결하는 방법을 알아보세요.

• 우샤 신장 케어 파운데이션

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